⒈规模偏小、实力较弱。××县个农村专业合作经济组织平均每个组织拥有会员人，最小的只有人，由于规模编小，带动和辐射农户一般只在本村本了范围内，能发挥区域性带动作用的专业合作组织较少，有时当一部分农村专业合作组织资金不足，公共积累很少，如××县百步镇的水产专业合作社，基地水产养殖面积亩，但股本金只有万元，大量资金靠贷款，社员所需的饲料、药品靠合作社的信誉来向有关厂家赊销、养殖业不确定因素多、市场风险压力较大。制约了合作社的健康发展。
⒉外部环境不适应。主要体现在以下三个方面：一是法制环境不适应。目前我国还没有制定专门的合作经济法，各极政府也未出台有关农村专业合作经济组织的法规，专业合作社究竞以何科身份进行工商登记，还缺乏法律的界定。我县现有的农村专业合作社基本上都是以合伙企业的身份进行工商登记，由此造成合作社税费的增加，影响了农民办社积极性。二是政策环境不适应。我县为鼓励专业合作经济组织的发展先后制订了一些扶持政策，但扶持力度不强，一些政策无法落实到位。如对新建专业合作经济组织，县农业发展基金一次性补助——元，但对于如元通兔业生产专业合作社这一类建社时间长，辐射带动能力强，动作较规范，社员增收明显的专业合作社缺乏有力，持续的扶持政策。已建有多年的乡镇农业担保基金（每个乡镇农业基金安排万元）由于可操作性差，基本没有动作。目前还没有一个乡镇为农业专业合作组织提供过贷款担保。工商、税收对专业合作经济组织也还没有打算的减负、扶持政策。三是体制环境不适应。目前农经、民政、工商、科协等部门都参与农村专业合作经济组织的管理，多头领导，政出多门，导致职责不清，任务不明，效率很低，管理不力，给专业合作经济组织的发展壮大带来一定影响。
三、动作机制不够完善。一是组织程度不高。内部松散，一些会员（社员）习惯于一家一户的分散经营方式面对专业合作经济组织，没有很强的集体观念，譬如订单农业、往往出现见利忘义的现象，市场收购价格高，农户就不管订单直接把农产品买给小贩，合作组织完不成任务，就要面临违约责任，而一旦市场滞销，农民就会抱怨合作经济组织或给政府施压，使许多合作经济组织不敢或无法正常发挥应有的作用。二是市场主体弱、竞争力不强。目前 《某某县农村专业合作经济组织的调查与思考(第2页)》出自：www.89xue.com网
www.89xue.com 的专业合作经济组织，大多数是能人带动型式股份合作型，农民自主经营，缺乏现代经营理念，信息网络又不完善，农民的谈判能力、应变能力与市场经济不相适应，如××的绿里香名茶技术合作社生产的《绿里香》茶叶，无论从品牌、生产规模，炒作技术都达到一定标准，但在如何进入市场上却一愁莫展。目前还是靠走门串户的推销方式，严重影响了生产效益的提高和规模的发展，今年秦山蔬菜协会的毛豆生产，到了产销旺季，却不见收购商来收购，农户无所适从，只能干看兔，可就要重演去年包心菜的伤心史，这种农民被动进入市场、农产品的命运维系于几个小商贩的作法，大大增加了市场风险和农民收的不可测性。三是农业科技开发滞后，标准化程序低。农产品的市场竞争力主要表现为农产品的品质、价格和市场营销。而农产品的质量是根本，目前有很多专业合作社能够在供种、技术服务方面起到一定作用，但是我县制定标准化生产的只有家，而且标准化生产有些也只是流于形式，农户不是在专业组织的技术指导下按标准化生产的程序严格生产，仍然粗放经营，导致农产品供货多，质量不高，无法满足市场需求，加上农民往往一哄而上，产品雷同，集中上市，致使农产品销售不畅，甚至低销倾销，去年秦山的包心菜，由于日生产，分钱一斤也少有人问津，菜贱伤农，大批烂在地里。加入后，农产品的标准化生产、保鲜、包装技术水平，农药残留量，重金属含量，有害生物指标，往往直接影响到多只的市场准入问题。三是组织不健全。一些合作经济组织章程不全，内设机构不合理，分工不清，职责不明，办事效率低下，观念落后，影响了组织的正常动作，个别甚至处于瘫痪状态。
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