2、党的基层组织自身建设存在问题
当前，一些党组织不重视党的建设工作，治党不严，放松对党员干部的马克思主义教育，听凭各种非马克思主义的，甚至是反马克思主义的思想毒害、侵蚀党员干部。有的党组织、党的领导干部埋头经济工作，忽视党的建设，“一手硬、一手软”的问题始终没有得到很好的解决，有的观念陈旧，方法老化，党员教育照本宣科，效果差。
一些农村基层党员干部的素质并不能适应新形势的要求，他们或者缺乏驾驭市场经济的能力，不善于抓住机遇带领群众走上加快发展的增收致富之路；或者缺乏应对复杂局面的能力，不善于处理各种社会矛盾、协调不同 《农村党的基层组织建设的调研报告》出自：www.89xue.com网
www.89xue.com 利益关系，以维护农村改革发展稳定的大局.
3、党的基层组织所面临的执政能力建设问题
十六届四中全会把研究加强党的执政能力建设问题作为主题并作出决定，意义重大而深远。这是贯彻“三个代表”重要思想和十六大精神的重大举措，体现了时代要求、人民要求，表明我们党对执政规律的认识达到了一个新的高度。
基层党员、干部的素质和能力与新形势、新任务不相适应，特别是一些基层领导干部和领导班子中存在思想理论水平不高、依法执政能力不强、解决复杂矛盾本领不大、思想作风不端正、工作作风不扎实等问题。
一些地方基层党建工作薄弱，党的基层组织软弱涣散。改革开放以后，基层党组织如何定位，怎样适应新的变化发挥作用和扩大党的工作覆盖面，都是新的挑战。一些农村基层党组织长期处于软弱涣散状态，对群众的凝聚力下降。社区、新经济组织等领域党建工作明显滞后。这个问题不解决好，就会严重削弱党在基层的执政基础。
三、党的基层组织如何应对新的挑战
1、把改进党的基层组织建设与建立市场经济体制的目标有机地结合起来，首先以产权关系为纽带，调整和理顺企业党组织的隶属关系。政企分开、产权清晰、权责明确、管理科学是现代企业制度的基本要求。目前，企业按照建立现代企业制度的要求，逐步进行了公司制改造，企业产权主体由一元化变为多元化，企业与政府、企业与企业之间的关系主要依靠产权而不是依靠行政关系来维系。因此，在公司制企业，要按照谁投资谁管理的原则，以产权关系为纽带确定党组织的隶属关系。以产权关系为纽带确定企业党组织的隶属关系，有利于党组织围绕企业的生产经营开展工作，应当成为现代企业制度条件下企业基层党组织设置的一个重要原则。
其次，以归口管理为手段，理顺私营、个体经济组织党组织的管理关系。私营、个体经济是我国国民经济的重要组成部分，也是近年来发展最为迅猛的一个领域。要加强党对这一领域的领导，保证私营、个体经济健康发展，就必须在这些经济组织中建立健全党的组织，理顺党组织的隶属关系。凡有3名以上正式党员的私营企业，都要建立党的组织。个体劳动者集中的地方，有正式党员3名以上的，也要建立党的组织。同时，对私营、个体经济组织中党的基层组织要实行归口管理。可在私营企业协会、商会建立党委，统一归口管理本地区范围内的私营企业党组织；在个体劳动者协会建立党委，统一归口管理本地区范围内的个体工商户党组织。
2、抓好“四个环节”，确保农村党的基层组织自身建设工作落到实处
抓教育，切实提高农村基层党员干部的思想觉悟以及带领群众致富奔小康的能力。要重视加强农村党员干部的政治、思想、理论建设，用邓小平理论和“三个代表”重要思想及现代科技知识武装党员干部的头脑。在发展市场经济的今天，农村各级党组织在着力提高农村党员干部为人民服务思想觉悟的同时，要教育他们不断增强为人民服务的能力，使农村党员干部努力做到科技兴农先学一步，在农村产业结构调整上先走一步，在发展二、三产业上先干一步。鼓励他们带头致富的同时，还要做农村政策的宣传员，向农民群众及时、准确地提供各种政策信息、科技信息等，帮助农民解决“市场要什么，种什么赚钱”的问题，做发展经济的服务员，向农民群众提供生产经营所需要的资金和农用生产资料等。通过组织发动党员干部为农民群众搭台子、出点子，努力走出一条先富帮后富、齐帮困难户的路子，全心全意带领群众共同致富奔小康。
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